风流倜傥、武功高强的张无忌在光明顶一战后继任了明教第三十四代教主，结束了明教长达十年的混乱局面。然而，这位年轻教主德微言轻，除了杨左使和几名五行旗使对他比较尊重外，其它教众对这位新任教主能力都缺乏了解。而张无忌夜御十女的风流韵事此时又恰巧在教内流传，搞得众多女教众人心惶惶。面对五行旗各自所遇到的灾害和困难，年轻的张教主奔走于五行旗管辖地界之内，斩妖除魔，平暴安良，要凭一己之力赢得教众们的信任和支持.....
（插图：游戏封面） （插图：众人迎接张无忌）
游戏的故事基于金庸原著，却又在原著基础上进行了大胆的拓展，对明教的一众事宜展开了丰富的联想。使得《倚屠-魔教教主》的世界观比其它各款改编游戏都要丰满。故事开始在巨木旗，杨左使有事不在。张无忌只要沿着路一直往上走，就会自动触发剧情。巨木旗的教众们欺负张无忌是新来的，让教主独自去吞猫平原收拾一种叫牛猫的怪物。在出发前，张无忌要先去拜访旗下的铁匠、裁缝和厨子，这三个人就在地图两边，很好找。
（插图：井边的铁匠赵大锤和帐篷边的女裁缝熊绣花）